В судах Узбекистана проходят закрытые процессы против обвиняемых в организации массовых волнений в Андижане, за причастность к которым к различным срокам заключения приговорены 73 человека.
Верховный Суд Узбекистана 28 декабря вынес приговор девяти сотрудникам андижанской милиции и двум врачам тюрьмы. Руководители Андижанского УВД и сотрудники
Несмотря на то, что судебные процессы, связанные с андижанскими событиями были объявлены закрытыми, национальное телевидение продемонстрировало кадры признательных показаний осужденных. Одним из главных виновных в кровавых андижанских событиях называют министра внутренних дел Зокира Алматова. После отказа в расследовании избыточного применения силы Европейский Союз запретил выдачу въездных виз двенадцати должностным лицам, причастным к подавлению андижанского мятежа. Однако, не смотря на санкции, Алматову удалось получить немецкую визу как частному лицу для получения медицинского лечения в онкологической клинике Германии. Между тем, 12 декабря несколько узбекских граждан, при содействии международной правозащитной организации «Human Rights Watch» подали федеральному прокурору иск о возбуждении уголовного преследования в отношении Алматова по трем пунктам: отдельные эпизоды пыток; пытки как преступление против человечества и андижанский расстрел как преступление против человечества. 22 декабря Зокир Алматов покинул свой пост, как представляется, по состоянию здоровья, перед отставкой получив от президента орден «За великие заслуги перед Родиной». Он возглавлял министерство внутренних дел с 1991 г. Будучи одним из самых влиятельных лиц в правительстве, Алматов играл главную роль в борьбе президента Каримова против инакомыслия. Бывший министр срочно покинул Германию после появления в СМИ сообщений о том, что жертвы пыток и уцелевшие после расстрела митинга в Андижане, обратились к прокурору Германии с просьбой возбудить уголовное дело против Алматова.
Организация Human Rights Watch заявила в этой связи, что: «Германский прокурор должен возбудить дело об ответственности за преступления против человечества в отношении министра внутренних дел Узбекистана Закиржона Алматова, даже если тот покинул страну. Не исключено, что у прокурора может оказаться достаточно оснований для постановки вопроса о выдаче международного ордера на арест Алматова».
Правозащитники настаивают на уголовном расследовании и говорят о том, что внутреннее немецкое законодательство позволяет суду рассматривать особо вопиющие преступления вне зависимости от места совершения и гражданства обвиняемых и пострадавших. Бывший специальный докладчик ООН по пыткам Тео Ван Бовен поддержал правозащитников и выступил со своим заявлением. «Пребывание на лечении в Германии министра внутренних дел Узбекистана дает жертвам произвола в Узбекистане исторический шанс добиться правосудия за тяжкие преступления пыток и массовых убийств, предусматривающие уголовную ответственность для министра Алматова»- говорится в нем. Однако, президент Ислам Каримов заручился политической поддержкой России и Китая, тем самым, давая понять о том, что не намерен менять методы борьбы против религиозного экстремизма. И хотя отставка Зокир Алматова последовала после передачи уголовных материалов германскому прокурору, аналитики говорят, что едва ли уход бывшего министра связан с давлением Запада.
Назначенный новый министр внутренних дел Баходир Матлюбов, с 2001 года занимал должность председателя государственного таможенного комитета, до этого он был первым заместителем министра внутренних дел Узбекистана.